超排卵时，由于大量的卵泡同时募集发育，故每个周期的排卵量大大增加。有人担心反复促排卵是否会造成因过度消耗卵泡资源而影响卵巢功能，从而影响正常月经周期甚至导致过早绝经。
 

正常情况下，妇女卵巢中卵泡的储备在新生儿出生时就已经确定，除在生育期大约有300～400个卵母细胞发育成熟并经排卵过程排出外，99%的卵泡均在各个发育阶段中退化闭锁，超排卵是将本应退化闭锁的窦卵泡继续生长发育。
 

研究证明，对卵巢功能正常的妇女，超排卵不会明显影响卵巢功能。无论超排卵还是卵泡穿刺治疗，都只能起到短期减少卵巢窦卵泡数目与改善月经周期的作用，对于长期的卵巢储备并无大的影响。
 

对于卵巢储备功能低下的患者，超排卵后早绝经的发生主要是患者本身卵巢储备功能的不足所导致。究竟超排卵是否加速了绝经期的开始，由于缺乏随机对照研究，目前尚无法定论。